R语言绘制染色体的一部分。genomicProbePlot()函数-中英文对照帮助文档
By MicroRbt Martinez PhD
R语言函数名:genomicProbePlot()
R语言函数功能:绘制染色体的一部分。
来自资源库:Bionconductor-software
genomicProbePlot()函数所属R语言包:所在R包具体名称、包功能的中英文双语描述见正文后面'--所在R语言包信息--'部分。
描述-----Description-----
These functions are used when we need to plot one or both strands of a section of chromosome.
当我们需要绘制一条染色体的一条或两条链时,可以使用这些功能。
使用方法-----Usage-----
genomicPlot( xrange, gene.area.height=NULL, gene.layout.padding=100, highlights=NULL, draw.opposite.strand=FALSE, exon.depth.plot=genomicExonDepthPlot,
padding.lines=1, .genes=NULL, .exons=NULL, invert.strands=FALSE, draw.scale=TRUE, ... )
genomicExonDepthPlot( .exons, start, end, exon.depth.alpha=0.1, exon.depth.col='black', ... )
genomicProbePlot( probes, start, end, probe.col='green', probe.alpha=0.3, ... )
参数-----Arguments-----
参数xrange介绍: An IRanges object representing the region of interest (with a strand if reqd)
代表感兴趣区域的IRanges对象(如果需要则带有链)
参数gene.area.height介绍: If NULL then both strands to max height of either of them, else if NA then both strands limited to their implied height otherwise, if an integer then both strands limited to the specif
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