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一些常用的数据,处理好,放在mySQL里,以后使用起来也方便。
可以用R直接进行分析,具体步骤如下:
1、R下载RODBC包,安装好。
2、在http://dev.mysql.com/downloads/connector/odbc
下载mySQL ODBC,安装好。
3、windows:控制面板->管理工具->数据源(ODBC)->双击->添加->选中mysql ODBC driver一项
填写:data source name 一项填入你要使用的名字,自己随便命名,例如:mysql_data;
description一项随意填写,例如mydata
TCP/IP Server 填写本机服务器IP,一般为:127.0.0.1
user 填写你的mysql用户名
password 填写你的mysql密码
然后数据库里会出现你的mysql里的所有数据库,选择一个数据库。
确定。
4、打开R的界面调用数据库:- library(RODBC);
- channel <- odbcConnect("mysql_data", uid="root", case="tolower");
- sqlTables(channel);#查看数据中的表
- data<-sqlFetch(channel,"kegg")# 查看表的内容,存到数据框里
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